90年代克罗地亚独立，克罗地亚国家队也正式成立。由于之前南斯拉夫出产了大量优秀球星，故克罗地亚一立国亦继承了很多出色猛将。在其国家独立后，克罗地亚在世界杯和欧锦赛上的成绩可圈可点；其中，1998年，克罗地亚队第一次参加世界杯便取得了季军的好成绩，苏克还成为了最佳射手。
辉煌过后的克罗地亚足球，多年来不断发展、人才济济。然而在世界杯的舞台，“格子军团”却深陷阴霾：2002年韩日世界杯小组未能出线，2006年德国世界杯未能晋级16强，2010年南非世界杯未能入围决赛圈，2014年巴西世界杯小组未能出线。

2017年11月12日，克罗地亚通过欧洲区附加赛，获得2018年俄罗斯世界杯的参赛资格，是第5次参赛。